0694-35806827

我们只用绿色的食品原料

吉林市澳彩网App下载股份有限公司零食加工厂,只为您的健康着想

‘澳彩网网手机APP下载’新方法显著改善宏基因组测序

2021-01-29 01:51上一篇:澳彩网App下载|各路明星豪宅曝光 |下一篇:没有了

本文摘要:在新的研究中,俄罗斯圣彼得堡国立大学的研究者开发了大幅度提高在实验室培育不到的生物,例如生活在人胃肠中的微生物、生活在海洋深处的细菌DNA的测序能力的方法。相关研究结果将于2016年2月1日在NatureMethods杂志上发表,论文标题为tru spades : barcodeassemblyoftruseqsyntheticlongreads。

澳彩网App下载

在新的研究中,俄罗斯圣彼得堡国立大学的研究者开发了大幅度提高在实验室培育不到的生物,例如生活在人胃肠中的微生物、生活在海洋深处的细菌DNA的测序能力的方法。相关研究结果将于2016年2月1日在NatureMethods杂志上发表,论文标题为tru spades : barcodeassemblyoftruseqsyntheticlongreads。

这种被称为TruSPADES的方法是将Illumina公司的机器产生的长300碱基对的短测序片段(shortreads )转换成基因组中宽约10,000碱基对的所谓宽幅测序片段(syntheticlons ) 研究人员表示,为了制作这些广阔的测序片段而不是短测序片段来组装基因组,只不过是用来在整个章节中组装书而不是单一句子。因此,人们有反感的动机,利用宽测序片段改良测序。论文作者PavelPevzner教授说,这是下一代测序技术。

对宏基因组测序的操作者有深远的影响。目前,PacificBiosciences和OxfordNanopore公司生产的长测序段是不准确的,是解决问题的简单测序问题,比如这样制备的宽测序片段的正确性需要提高100倍,大规模缓慢产生并复盖面积宏基因组中的大部分细菌。为了开发这种新方法,研究者提供了载有条形码的长100~300碱基对的短测序片段。

澳彩网网手机APP下载

他们随后用短测序中常用的被称为解耦图(deBrujingraph )的方法描绘这些测序片段,并将其组装起来制作了宽测序片段。这个德蓝图允许研究者确认哪个短测序片段是相连的,组装更长、更正确宽度的测序片段。

其次,适用于该方法的研究是包括人微生物群到海洋微生物群在内的许多微生物群落。Pevzner和另一位论文作者AntonBankevich与美国克雷格文特尔研究所(J.CraigVenterInstitute )的研究员ChristopherDupont合作积极开展这方面的研究。

澳彩网App下载

宏基因组学特别充满著挑战,这是因为研究者必须研究生活在一个微生物群落中的数百种细菌,不能研究其中的个别细菌菌种。研究人员从这个微生物群落中提取样本并展开测序后,他们从这个群落内所有细菌基因组中获取了片段。

这看起来像是要做几百个积木,但我不知道属于哪个积木。TruSPADES法和宽测序片段的制造有助于研究者制作这些积木。

Dupont先生说这种方法能以更小的成本带来更好的结果。我们现在正在组装我们不存在的生物基因组。


本文关键词:‘,澳彩,网网,手机,APP,下载,’,澳彩网App下载,新方法,显著

本文来源:澳彩网App下载-www.yaboyule91.icu